Una investigación difundida por CNN señala que la Agencia Central de Inteligencia de Estados Unidos (CIA) habría ejecutado operaciones encubiertas contra grupos del narcotráfico en territorio mexicano, en medio del endurecimiento de la estrategia bilateral contra los cárteles.  

De acuerdo con los reportes, estas acciones se habrían realizado con apoyo de labores de inteligencia y colaboración de corporaciones locales, aunque algunas operaciones presuntamente ocurrieron sin conocimiento pleno del Gobierno federal mexicano, lo que desató una nueva controversia sobre la presencia de agentes extranjeros en el país.  

La polémica tomó fuerza tras el operativo en Chihuahua relacionado con un narcolaboratorio, donde murieron agentes estadounidenses y funcionarios mexicanos. El caso provocó investigaciones de la Fiscalía General de la República por posibles violaciones a la soberanía nacional y derivó en cuestionamientos políticos sobre la cooperación con agencias de seguridad de Estados Unidos.